Melatonina stosowana jest przede wszystkim w zaburzeniach snu związanych z zachwianiem rytmu dobowego (praca zmianowa) oraz szybką zmianą stref czasowych (tzw. jag lag syndrome, występujący u ludzi podróżujących, zmieniających strefy czasowe). Podawana jest ludziom niewidomym, u których pojawiły się problemy ze snem.

Jej pozytywny wpływ na sen przejawia się w postaci:

1. Ułatwiania zasypiania,

2. Zmniejszeniu epizodów wybudzania się,

3. Poprawy „jakości” snu.

Melatonina przejawia także, poza regulacją snu, wiele innych działań:

1. jest „wymiataczem” wolnych rodników,

2. wzmacnia odporność,

3. reguluje procesy dojrzewania.

Przeciwwskazania do zażywania melatoniny obejmują nadwrażliwość na preparat oraz choroby wątroby (melatonima jest metabolizowana przez wątrobę). Mimo pozytywnych wyników niektórych badań, wykazujących wpływ na konsolidację snu, nie jest zalecana dzieciom. Podobne ograniczenia obowiązują w okresie ciąży i karmienia piersią. Najczęściej występujące objawy uboczne to: bóle i zawroty głowy, senność, zaburzenia koncentracji.

Polsce zarejestrowane są 3 formy melatoniny. Dostępne bez recepty: Melatonina LEK-AM (1, 3 i 5mg) i  Melatonina VIS (3mg) oraz dostępny na receptę: Circadin Lundbeck (2mg tabletki o przedłużonym uwalnianiu).